Het hoofdorgel in de Pieterskerk is gebouwd door Pels en van Leeuwen in 1968. Het heeft drie manualen. Het Pelsorgel is specifiek gebouwd om er Franse orgelmuziek op te laten klinken en heeft daarom ook bijzondere registers en een zwelkast.
In 2022 werd begonnen met de restauratie en schoonmaak van het orgel. In het bouwjaar van het orgel werden plastic slepen, die voor de luchttoevoer naar de pijpen zorgen, als noviteit in het orgel geplaatst. Nadeel van dit materiaal was de grote slijtage. Daarom zijn bij de restauratie de kunststof slepen vervangen door nieuwe houten exemplaren. Het orgel is gedemonteerd om de slepen te kunnen herstellen en de kast – na 55 jaar gebruik – goed schoon te maken. Herstel en onderhoud zijn uitgevoerd door de firma Elbertse.
Het hoofdorgel is inmiddels teruggeplaatst en weer in gebruik genomen.
